Inkaterra protegge oltre 17 mila ettari di foresta amazzonica, promuovendo la riduzione di circa 3.315.000 tonnellate di CO2 ogni anno. E' stata la prima organizzazione turistica in Perù a misurare l'impatto ambientale della sua attività grazie alla collaborazione con l’Institute for Earth and Biosphere e della University of Leeds in Inghilterra, iniziata negli anni 90. I suoi programmi di protezione ambientale comprendono il monitoraggio di flora, fauna, acqua, aria e paesaggio nella foresta pluviale amazzonica sud-orientale e nelle Ande meridionali.